Pada tanggal 8 Maret 1951 merupakan peristiwa penting bagi Gereja Larantuka di Flores dimana pada saat tersebut Larantuka diresmikan sebagai Vikariat oleh Paus Pius XII. Mgr. Gabriel Manek, SVD ditahbiskan menjadi Vikaris Apostolisnya, 25 April 1951. Kemudian mulai tanggal 24 Januari 1961 dimana pada saat Paus Yohanes XXIII mendirikan Hierarki Gereja di seluruh Indonesia, vikariat Larantuka berganti nama menjadi Keuskupan Larantuka. Kemudian Keuskupan Larantuka dipimpin oleh Mgr. Gabriel Manek, SVD, Mgr.Antonius Hubertus Thijssen SVD, Mgr. Darius Nggawa, SVD. Dan saat ini dipimpin oleh Mgr. Fransiskus Kopong Kung, Pr.
Pada masa kepemimpinan Mgr. Fransiskus Kopong Kung, Pr, Keuskupan Larantuka sudah menziarahi tahun-tahun (2008 hingga 2012) yang penuh dengan rahmat. Tahun 2012 adalah tahun “jedah” yaitu melakukan “evaluasi dan refleksi”.